黄尊素（1584－1626），字真长，余姚(今浙江省余姚市)人。明末重臣。黄宗羲父亲，东林党成员，明朝末年被冤杀的“七君子”之一。
万历四十四年(1616)进士。授宁国推官、升御史。精敏强执。力陈时政十失，抗疏论劾魏忠贤，论万燝廷杖卒，数次得罪忠贤，被忠贤党曹钦程弹劾，革职。他謇谔敢言，尤有深识远虑。
汪文言初下狱，忠贤即欲罗织诸人罪，知尊素能识破他的阴谋。忠贤恨甚，指使李实弹劾他，被捕。拷打备至，知狱卒将害己，赋诗一章，遂死。崇祯初，赠太仆卿。福王时，追谥忠端。